北京市眼科研究所、北京市耳鼻咽喉科研究所、北京市糖尿病研究所與醫(yī)院主體并稱“一院三所”，成為集醫(yī)療、教學、科研、預防、國際交流五位一體的醫(yī)療科研聯(lián)合體。眼科、耳鼻咽喉科為教育部批準的國家臨床重點學科，變態(tài)反應(鼻過敏)科為原國家衛(wèi)生和計劃生育委員會批準的國家臨床重點專科，中醫(yī)眼科學為國家中醫(yī)藥管理局批準的中醫(yī)重點學科。首都醫(yī)科大學北京眼科學院和耳鼻咽喉科學院設在院內(nèi)。醫(yī)院設有世界衛(wèi)生組織防盲合作中心和世界衛(wèi)生組織防聾合作中心，附設北京同仁眼庫(國際眼庫協(xié)會會員)。
同仁醫(yī)院歷經(jīng)百余年發(fā)展，凝練出“精誠勤和”的醫(yī)院精神。在新的歷史時期，同仁人將繼承和發(fā)揚百年同仁優(yōu)良傳統(tǒng)，弘揚主流文化，苦練內(nèi)功，精于內(nèi)涵，團結(jié)一致，創(chuàng)新發(fā)展，努力為人民群眾提供優(yōu)質(zhì)、、快捷的醫(yī)療服務。
在臨床相關研究方面，眼底?？崎_展了增生性玻璃體視網(wǎng)膜病變發(fā)病機制的研究，視網(wǎng)膜下人工假體植入技術及組織相容性研究，高度近視眼致病基因定位及蛋白質(zhì)組學分析，黃斑營養(yǎng)不良的致病基因定位研究，年齡相關性黃斑變性發(fā)病危險因素和早期干預研究，以及眼病的流行病學研究等。持續(xù)不斷的獲得了多項及省部級課題經(jīng)費的支持。發(fā)表了系列高質(zhì)量研究論文，形成了同仁品牌效應和國際影響力。北京同仁醫(yī)院眼底?？茍猿忠耘R床服務為根本，以科研創(chuàng)新為導向，醫(yī)療、教學、科研、預防發(fā)展的目標，推動了創(chuàng)新型的科學研究工作的持續(xù)開展和學科臨床服務水平的不斷提高。
作為具有同仁特色的科室，眼外傷專科特別注意與口腔頜面外科、神經(jīng)外科、鼻科等兄弟?？频暮献鳎诮徊鎻秃蠈W科發(fā)展上在國內(nèi)獨樹一幟。眼外傷?？婆c耳鼻喉科成立了鼻眼相關中心，聯(lián)合開展了復合路徑下的眶壁骨折整復術、多重療法的視神經(jīng)管減壓術、合并鼻骨骨折的鼻淚道手術和眶-鼻竇異物取出、眶面復合創(chuàng)傷多學科多層次多斷面聯(lián)合;與神經(jīng)外科合作，率先開拓經(jīng)顱顯微視神經(jīng)管減壓開放術、眶顱異物取出術，大大提高了手術成功率。
